Was Sie (leider immer nur sehr oberflächlich und anscheinend auch nicht systematisch getestet) beschreiben, klingt eher nach einem clientseitigen Problem und nicht besonders UCS-spezifisch. Unter UCS gibt’s von Haus aus keine Mechanismen, die irgend etwas mit irgendwelchen Daten-Ordnern machen. Vielleicht ist so eine Frage daher besser in allgemeinen Windows-Foren aufgehoben.
Generell sollten Sie versuchen, das Problem zu reproduzieren und einzugrenzen, unter welchen Bedingungen was genau auftritt. Dafür habe ich oben einige Anhaltspunkte gegeben, aber die haben Sie praktisch nicht weiter beachtet. Mit »die Dateien landen irgendwo« kann ich nicht viel anfange; schauen Sie doch wirklich einmal mit dem von mir erwähnten »find« nach, wo sie tatsächlich liegen. Falls sie gar nicht auf dem Server aufzufinden sind, so können Sie als nächstes probieren, was passiert, wenn man sich am betroffenen Client abmeldet (Stichwort clientseitiges Caching). Wird die Datei dann vielleicht auf den Server geschrieben? Erneut mit »find« überprüfen!
Kurz: gehen Sie systematisch vor, testen Sie einen Punkt nach dem anderen, versuchen Sie Sachen auszuschließen, und verifizieren Sie jede Vermutung, die Sie haben. Sinnvollerweise auch schriftlich festhalten, was Sie alles genau wie probiert haben.
Nicht vermuten, testen! Schauen Sie auf den betroffenen Clients in dem Moment nach, ob die verwendeten kurzen und vollen Hostnamen des Servers wirklich identisch aufgelöst werden.
Gruß,
mosu