Der Fehler entsteht, weil die CA von Let’s Encrypt im globalen CA-Store des Systems nicht gefunden werden kann.
Die Lösung des Problems steht im README der App, welches nach der Installation auf der App-Seite angezeigt wird:
update-ca-certificates
Die App fügt das Root-Zertifikat von Let’s Encrypt in den globalen CA-Store auf dem System hinzu. Dieser muss jedoch danach mit obigem Kommando einmal neu geladen werden. Früher hat die App das selbst gemacht. Es hat sich jedoch herausgestellt, dass dies nicht immer zuverlässig funktioniert, wenn dabei das App Center geöffnet ist (was beim Installieren und Einrichten der App meist der Fall ist), weswegen dieser Schritt einmal manuell auf der Kommandozeile erledigt werden muss.
Die Meldung unterscheidet sich, weil sich mit dem letzten Update der App der Dateiname des Zertifikats geändert hat. Das Problem an sich ist aber das gleiche. @ahrnke Dennoch danke für Ihren Hinweis auf das Vorgehen im Bugzilla.
Es ist aktuell angedacht die App unter der Haube so anzupassen, dass es gar nicht mehr notwendig ist den CA-Store zu verändern.